Alors qu'Ana Dakkar s'apprête à passer les épreuves de première année à l'académie de Harding-Pencroft, réputée pour former les meilleurs biologistes et explorateurs marins, une explosion détruit le bâtiment, tuant de nombreux élèves et professeurs. Ana apprend alors qu'elle est la descendante du fameux capitaine Nemo et qu'elle est la seule à pouvoir retrouver les trésors qu'il a cachés.